Zudem engagierte er sich für weitere gemeinnützige Stiftungen, so war er unter anderem 15 Jahre Vorsitzender des Kuratoriums der Stiftung für die Hamburger Kunstsammlungen und wurde 2011 zum Ehrenmitglied des Kuratoriums ernannt. Dem American Field Service – kurz AFS – war er verbunden. Er engagierte sich im internationalen Aufsichtsrat des AFS, war ein wichtiger Förderer des AFS in Deutschland sowie Gründungsmitglied dessen Kuratoriums, dem er 25 Jahre angehörte. Von 2004 bis 2012 übernahm er den Vorsitz der AFS Stiftung.

Für sein herausragendes Engagement wurde Jürgen Blankenburg 2009 mit dem Bundesverdienstkreuz ausgezeichnet.

Das Deutsche Stiftungszentrum und der Stifterverband danken Jürgen Blankenburg für sein beispielhaftes Engagement und werden ihn als Mensch und Stiftungspersönlichkeit stets in gutem Gedenken behalten.